সমস্ত ইসলামী বিশ্ববিদ্যালয়গুলো প্রথমে কোনো না কোনো জামে মসজিদের ছাদের নীচে শুরু হয়েছিল। আর সেই কারণে এগুলোকে ‘জামেয়া’ বলা হয় । যেমন জামেয়া আজহার, জামেয়া কারউইন, জামেয়া জয়তুনা ইত্যাদি। এসব বিশ্ববিদ্যালয়ে দ্বীনী শিক্ষার পাশাপাশি জাগতিক বিজ্ঞানের বিভিন্ন বিষয় পড়ানো হতো। এজন্য তখন অনেকেই বৈজ্ঞানিক পরীক্ষা-নিরীক্ষার সাথে সাথে ধর্মীয় বা দ্বীনী জ্ঞানেও অনেক পারদর্শীতা অর্জন করেছিলেন। যেমন কাজী ইবনে রুশদ তুলনামূলক আইন শাস্ত্রের বিখ্যাত বই বিদায়াতুল মুজতাহিদ এর লেখক, সেইসঙ্গে তিনি চিকিৎসা শাস্ত্রের সুপরিচিত বই কুল্লিয়াত রচনা করেন। আল খাওয়ারিজমি একটি বিখ্যাত বই লিখেছেন যেটি অধিকার বঞ্চিত মানুষের জন্য তাদের উত্তরাধিকার সংক্রান্ত সমাধানের ভিত্তিস্বরূপ ।