স্বনামখ্যাত নোয়েটিক বিজ্ঞানী ক্যাথরিন সলোমনের একটি লেকচার শোনার জন্য জাদুর শহর প্রাগে পা রাখে সিম্বলজিস্ট রবার্ট ল্যাংডন। মানুষের মন, চেতনা এবং চিন্তাপ্রক্রিয়া নিয়ে হাজার বছরের প্রতিষ্ঠিত বিশ্বাসকে নাড়িয়ে দেবার মত একটি বই প্রকাশ করতে যাচ্ছে ক্যাথরিন। এমনই সময় প্রাগে ঘটে যায় নৃশংস একটি হত্যাকাণ্ড; নিখোঁজ হয়ে যায় ক্যাথরিন, সেই সাথে তার বইটির পাণ্ডুলিপি। ল্যাংডন বুঝতে পারে, প্রবল ক্ষমতাধর একটি শক্তি রয়েছে এসবের পেছনে। অন্যদিকে প্রাগের প্রাচীনতম পৌরাণিক কাহিনি থেকে উঠে আসা এক আততায়ীও সক্রিয় হয়ে ওঠে। কিন্তু তারা কী চায়, সে সম্পর্কে কিছুই জানে না ল্যাংডন কিংবা ক্যাথরিন। প্রাগ-লন্ডন-নিউ ইয়র্ক পর্যন্ত ষড়যন্ত্রের জাল ছড়িয়ে আছে। হন্যে হয়ে ল্যাংডন খুঁজতে থাকে ক্যাথরিনকে, তার কাছেই আছে সমস্ত প্রশ্নের উত্তর রুদ্ধশ্বাস অভিযান শেষে উন্মোচিত হয় ভয়ঙ্কর একটি সত্য-আবিষ্কৃত হয় মানবজাতির ধারণা চিরতরের জন্য পাল্টে দেবার মত গোপন একটি প্রজেক্ট-'থ্রেশহোল্ড'। দ্য দা ভিঞ্চি কোডখ্যাত জনপ্রিয় খুলার লেখক ড্যান ব্রাউনের ল্যাংডন-সিরিজে ষষ্ঠ বই দ্য সিক্রেট অব সিক্রেটস যথারীতি পাঠককে রুদ্ধশ্বাস অভিযানের স্বা দেবে।